"Secret Headquarters" චිත්රපටය යනු තරුණ චාලි (වෝකර් ස්කොබෙල්) සහ ඔහුගේ මිතුරන්ගේ කතාව අනුගමනය කරන සුපිරි වීර ප්රහසන චිත්රපටයකි. කතාව ආරම්භ වන්නේ චාලි ඔහුගේ පියා වන ජැක් කිංකේඩ් (ඕවන් විල්සන්) ගැන අභිරහස් දෙයක් සොයා ගැනීමත් සමඟය. ජැක් යනු "ද ගාඩ්" ලෙස හඳුන්වන සුපිරි වීරයෙකි.
කතාවේ දී, ජැක් වරක් බලගතු පිටසක්වල ශක්ති ප්රභවයක් අඩංගු කඩා වැටුණු අභ්යවකාශ යානයක් සොයා ගත්තේය. මෙම සිදුවීමෙන් පසු, ජැක් තම පවුල් ජීවිතයට අහිතකර ලෙස බලපාන මෙම බලශක්ති ප්රභවය ආරක්ෂා කිරීම සඳහා තම ජීවිතය කැප කරයි. ඔහු තම බිරිඳගෙන් වෙන්ව සිටින අතර ඔහුගේ පුත් චාලි සමඟ ඇති සම්බන්ධයද දුර්වල වේ.
චාලි සහ ඔහුගේ මිතුරන් දිනක් ජැක්ගේ නිවසේ නැවතී සෙල්ලම් කරමින් සිටියදී, අහම්බෙන් ජැක්ගේ රහස් මූලස්ථානය සොයා ගනී, එය ඔවුන්ගේ නිවස යට සඟවා ඇත. චාලි සහ ඔහුගේ මිතුරන් මෙම මූලස්ථානයට ඇතුළු වූ විට, ඔවුන්ගේ පියා සැබවින්ම සුපිරි වීරයෙකු බව ඔවුන්ට වැටහේ.