"ට්‍රාන්ස්ෆියුෂන්" චිත්‍රපටය හිටපු විශේෂ බලකායේ ක්‍රියාකාරිකයෙකු වන රයන් ලෝගන් (සෑම් වර්තින්ටන්) වටා ගෙතෙන තීව්‍ර හා චිත්තවේගීය කතාවකි. රයන් යනු තම බිරිඳගේ මරණයෙන් පසු තම එකම පුත් බිලී සමඟ ජීවිතය ගත කිරීමට උත්සාහ කරන පියෙකි. මෙම කතාව පියෙකු සහ පුතෙකු අතර සම්බන්ධතාවය නිරූපණය කරනවා පමණක් නොව, පශ්චාත් යුධ ජීවිතයේ අභියෝග සහ මානසික සෞඛ්‍ය ගැටළු ද ඉස්මතු කරයි.
කතාව ආරම්භ වන්නේ රයන් ඉරාකයේ මෙහෙයුමක් අතරතුර තුවාල ලබන ඔහුගේ අතීතයෙන් ය. මෙම සිදුවීම ඔහුගේ ශරීරයට පමණක් නොව ඔහුගේ මානසික සෞඛ්‍යයටද ගැඹුරු බලපෑමක් ඇති කළේය. රයන් දැන් තනිකඩ පියෙක්, තම පුතාව ආරක්ෂිතව තබා ගැනීමට හැකි සෑම දෙයක්ම කරනවා. ඔහුගේ බිරිඳගේ මරණය ඔහුව දැඩි ශෝකයකට ඇද දමා ඇති අතර, ඔහු තම පුතාව මෙම ශෝකයෙන් ආරක්ෂා කර ගැනීමට අරගල කරමින් සිටී.
කතාව ඉදිරියට යත්ම, තම පුතා බේරා ගැනීම සඳහා අපරාධකාරී පාතාලයට ඇතුළු විය යුතු බව රයන් තේරුම් ගනී. ඔහු භයානක ලෝකයකට පා තබයි, එහිදී ඔහුට තම පුතාගේ ආරක්ෂාව සහතික කිරීමට පමණක් නොව, ඔහුගේ අතීතයේ අවතාරවලටද මුහුණ දීමට සිදුවේ. රයන්ගේ ගමන නිසා ඔහුට බොහෝ දුෂ්කරතාවන්ට හා අභියෝගවලට මුහුණ දීමට සිදු වේ. ඒ අතර ඔහුගේ සදාචාරය සහ පියෙකු ලෙස ඔහුගේ යුතුකම් සමතුලිත කිරීම ද වේ.