"Mission: Impossible - Ghost Protocol" චිත්රපටයේ කතාව ඉම්පොසිබල් මිෂන් බලකායේ (IMF) වැදගත් මෙහෙයුමක් වටා ගෙතී ඇත. කතාව ආරම්භ වන්නේ බුඩාපෙස්ට් හිදී වන අතර, IMF නියෝජිත ඊතන් හන්ට් (ටොම් කෲස්) හට "කොබෝල්ට්" නම් භයානක ත්රස්තවාදියෙකු පිළිබඳ තොරතුරු ලබා ගැනීම සඳහා කුරියර්වරයෙකු අල්ලා ගැනීමට නියෝග කරනු ලැබේ. නමුත් මෙහෙයුම අතරතුර, හන්ට් සහ ඔහුගේ කණ්ඩායම ක්රෙම්ලිනයට බෝම්බ හෙලීමකට තුඩු දෙන උගුලකට හසු වේ. බෝම්බ ප්රහාරය සම්බන්ධයෙන් IMF ආයතනයට දොස් පැවරෙන අතර, එමඟින් ඇමරිකානු රජය IMF වසා දමා "Ghost Protocol" ක්රියාත්මක කිරීමට හේතු විය. එයින් අදහස් වන්නේ සියලුම IMF සාමාජිකයින් දැන් ත්රස්තවාදීන් ලෙස සලකනු ලබන අතර ඔවුන්ට කිසිදු රජයේ ආධාරයක් අහිමි වන බවයි.
ජේන් කාටර් (පෝලා පැටන්), බෙන්ජි ඩන් (සයිමන් පෙග්) සහ නව සාමාජික විලියම් බ්රැන්ඩ්ට් (ජෙරමි රෙනර්) ඇතුළු ඊතන් හන්ට් සහ ඔහුගේ කණ්ඩායම ඔවුන්ගේ නිර්දෝෂීභාවය ඔප්පු කර සැබෑ ත්රස්තවාදියා අල්ලා ගන්නා අතරතුර දිවි ගලවා ගත යුතුය. සැබෑ දුෂ්ටයා න්යෂ්ටික යුද්ධයක් ආරම්භ කිරීමට සැලසුම් කරන ස්වීඩන් ජාතික හිටපු විශේෂ බලකායේ සාමාජිකයෙකු වන කර්ට් හෙන්ඩ්රික්ස් (මයිකල් නික්විස්ට්) බව ඔවුන් සොයා ගනී. රුසියානු න්යෂ්ටික මිසයිල සඳහා දියත් කිරීමේ කේත හෙන්ඩ්රික්ස් සතුව ඇති අතර, ඒවා ලබා ගැනීමට ඔහු ඕනෑම දුරක් යනු ඇත.
මෙම චිත්රපටයේ ඩුබායි හි බර්ජ් කලීෆා උසට නැගීම සහ මුම්බායි හි අවසන් මහා තරඟයක් වැනි ත්රාසජනක ක්රියාදාම අනුපිළිවෙලවල් කිහිපයක් ඇතුළත් වේ. මෙම දර්ශනවලදී, හන්ට් සහ ඔහුගේ කණ්ඩායමට ඔවුන්ගේ කුසලතා ප්රදර්ශනය කිරීමට පමණක් නොව, එකිනෙකා විශ්වාස කිරීමටද සිදුවේ, මන්ද සෑම සාමාජිකයෙකුටම තමන්ගේම පෞද්ගලික රහස් සහ අභිප්රායන් ඇති බැවිනි. කතාව ඉදිරියට යන විට, කණ්ඩායමට වැටහෙන්නේ තමන්ගේම ජීවිත පමණක් නොව, ලෝකය ද විභව න්යෂ්ටික ව්යසනයකින් බේරා ගැනීමට එක්ව කටයුතු කළ යුතු බවයි.