“Final Fantasy: The Spirits Within” චිත්‍රපටය 2065 වර්ෂයේ සිදු වූ විද්‍යා ප්‍රබන්ධ සජීවිකරණ චිත්‍රපටයකි. මෙම චිත්‍රපටයේ ප්‍රධාන චරිතය තරුණ විද්‍යාඥයෙකු වන ආචාර්ය අකී රොස් ය. පෘථිවියේ භයානක අර්බුදයක් පවතින අතර, එහිදී “ෆැන්ටම්ස්” නම් පිටසක්වල විශේෂයක් මනුෂ්‍යත්වය අනතුරේ හෙළා ඇත. මෙම ෆැන්ටම්ස් ආත්මයන් ලෙස පෙනී සිටින අතර ජීවීන්ගෙන් ශක්තිය සොරකම් කරමින් මනුෂ්‍යත්වයේ පැවැත්ම අනතුරේ හෙළයි.
ෆැන්ටම් කෙනෙකු විසින්ම ආසාදනය වී ඇති අකී රොස්, තම ජීවිතය බේරා ගැනීමට සහ පෘථිවිය මෙම අර්බුදයෙන් නිදහස් කිරීමට මෙහෙයුමක් ආරම්භ කරයි. ඇය ඇගේ පැරණි මිතුරිය වන ග්‍රේ එඩ්වර්ඩ්ස් විසින් මෙහෙයවනු ලබන “ඩීප් අයිස්” නම් විශේෂ හමුදා කණ්ඩායමක් සමඟ එක්වෙයි. අකී සහ ඇගේ සගයන්, වෛද්‍ය සිඩ් සමඟ එක්ව, සාමයට විසඳුමක් සොයා ගැනීමට හැකි වන පරිදි ෆැන්ටම්ස්ගේ රහස් හෙළි කිරීමට උත්සාහ කරයි.
චිත්‍රපටයේ හැරවුම් ලක්ෂ්‍යයක් පැමිණෙන්නේ බලවත් හා ආත්මාර්ථකාමී හමුදා නායකයෙකු වන ජෙනරාල් හයින් විනාශකාරී සැලැස්මක් සකස් කරන විටය. පෘථිවිය ද විනාශ කළ හැකි ඉතා විනාශකාරී උපක්‍රමයකින් ෆැන්ටම්ස් පරාජය කිරීමට ඔහු සැලසුම් කරයි. මෙම සැලැස්ම නැවැත්වීමට අකී සහ ඔහුගේ සගයන් අරගල කරන්නේ, එය ෆැන්ටම්වරුන්ගේ පමණක් නොව මනුෂ්‍යත්වයේ ද අවසානය සනිටුහන් කරන බව දැනගෙනය.