Mutant Chronicles යනු ඔබව අඳුරු හා භයානක අනාගතයකට ගෙන යන චිත්‍රපටයකි. කතාව 2707 වර්ෂය තුළ සකසා ඇති අතර, මානව වර්ගයා එහි ස්වභාවික සම්පත් අවසන් කර ඇති අතර යෝධ සමාගම් හතරක් අතර යුද්ධයක් ඇවිළෙමින් පවතී. මෙම යුද්ධය මධ්‍යයේ, පුරාණ යන්ත්‍රයක රහස හෙළි වන අතර එය මනුෂ්‍යත්වයට තර්ජනයක් වේ.

චිත්‍රපටය ආරම්භ වන්නේ භයානක සටන් දර්ශනයකින්. බෝම්බයක් වැටෙන විට, එය වසර දහස් ගණනකට පෙර පෘථිවියට වැටුණු පුරාණ යන්ත්‍රයක් මුදා හරියි. මෙම යන්ත්‍රය මිනිසුන් විකෘති බවට පරිවර්තනය කරයි, ඔවුන් දැන් ජීවත් වන්නේ මරා දැමීමට පමණි. දැන් මානසිකව විකෘති වී ඇති මෙම විකෘති යන්ත්‍රයට ඔවුන්ගේ නව ගොදුරු ගෙන එයි.

කතාවේ ප්‍රධාන චරිතය වන මේජර් මිච් හන්ටර්, මෙම තර්ජනයට මුහුණ දීම සඳහා කණ්ඩායමක් සාදන නිර්භීත සොල්දාදුවෙකි. මෙම කණ්ඩායමට යන්ත්‍රය විනාශ කළ හැකි පුරාණ පාඨයක් පිළිබඳ දැනුමක් ඇති ආගමික නායකයෙකු වන සහෝදර සැමුවෙල් ද ඇතුළත් වේ. එය සියදිවි නසාගැනීමේ මෙහෙයුමක් වන අතර එහිදී ඔවුන්ට විකෘතියන්ට එරෙහිව සටන් කර මනුෂ්‍යත්වය බේරා ගත යුතුය.